Вы когда-нибудь задумывались о том, что привычное деление живого мира на растения, животных и бактерии может быть не совсем верным? Оказывается, существует целая группа микроорганизмов, археи Asgard, чье открытие перевернуло наши представления об эволюции и происхождении сложных клеток, из которых состоим мы с вами.
Еще совсем недавно, каких-то десять лет назад, о существовании этих таинственных созданий никто и не подозревал. Лишь в 2015 году, анализируя донные отложения в глубинах океана, ученые наткнулись на генетические обрывки, указывающие на присутствие чего-то совершенно нового. Подобно старательным археологам, собирающим осколки древних ваз, исследователи, вооружившись мощными компьютерами, восстановили из этих фрагментов геном. И вот тут-то и стало ясно: перед ними — неизведанный мир архей.
Археи, как и бактерии, одноклеточны. Но не стоит их путать! Генетически они сильно отличаются, особенно в устройстве клеточных оболочек и метаболизме. Последующие поиски позволили микробиологам не только идентифицировать этих существ, но и выделить их в отдельную подгруппу — археи Asgard. Название выбрано не случайно: Asgard в скандинавской мифологии — обитель богов. А найдены эти микробы были неподалеку от Замка Локи — гидротермального источника в Атлантическом океане. Кажется, само Провидение направило ученых к этому открытию.
На криотомограммах Ca. L. ossiferum показывают различные цитоскелетные элементы в дополнение к локиактину. (A-D) Криотомографический срез (A) и соответствующая сегментация (B), показывающая длинную трубоподобную структуру диаметром 12-14 нм, охватывающую все тело клетки Ca. L. ossiferum. (C) и (D) показывают увеличенные виды концов трубки и потенциальных структур, соединяющих трубку с клеточной оболочкой. (E и F) Криотомограмма (E) и сегментация (F) трубчатой структуры (диаметр 16-18 нм), соединенной с клеточной оболочкой. (G и H) Пример тонкой (∼9 нм) трубчатой структуры в мембранных трубках клеточных выпячиваний. (A, C-E и G) Оранжевые наконечники стрелок указывают на филаменты локиактина, зеленые наконечники стрелок — на другие тонкие трубчатые структуры. Масштабные линейки: 100 нм. Цитирование: Wollweber et al., Microtubules in Asgard archaea, Cell (2025), https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.02.027
Разрушители шаблонов: как Asgard изменили родословную жизни
Именно Asgard стали тем самым недостающим звеном между простыми археями и эукариотами — организмами, чьи клетки имеют сложное строение и содержат ядро (к ним относятся, например, растения и животные). Это открытие поставило под сомнение привычную схему деления всего живого на три домена: бактерии, археи и эукариоты.
Некоторые ученые даже предложили пересмотреть эту классификацию и включить эукариот в состав Asgard. Тогда на древе жизни останется всего две основные ветви: бактерии и археи (включая, разумеется, и нас с вами, эукариот).
Профессор Мартин Пилхофер из Высшей технической школы Цюриха уже несколько лет занимается изучением Asgard. И вот, недавно, его команда смогла приоткрыть завесу тайны над внутренним устройством этих микробов. Исследовав Lokiarchaeum ossiferum, выделенного из донных отложений в Словении, ученые обнаружили у него структуры, характерные для эукариот. Например, белок актин, очень похожий на тот, что есть в наших клетках. Этот белок формирует нити, образующие своего рода скелет щупальцевидных выростов клетки Asgard.
Тубулины Asgard образуют эукариотоподобные гетеродимеры. (A) Крио-ЭМ анализ гетеродимера AtubA/B в присутствии GTP. Показаны 2D-классы, карты плотности (представлены с точностью +-3,5 σ) и атомная модель гетеродимера. Плотность, напоминающая GTP, была обнаружена на внутридимерном интерфейсе, а также в нуклеотид-связывающем кармане AtubA. (B) Наложение гетеродимера AtubA/B с неполимеризованным эукариотическим α/β-тубулином (PDB: 7QUD)44, выровненным по AtubB. Показаны значения RMSD для выровненных пар, что свидетельствует о близком структурном сходстве двух неполимеризованных гетеродимеров тубулина. Обратите внимание, что при полимеризации димер переходит из изогнутой в прямую конформацию. (C) Сравнение нуклеотид-связывающих карманов на внутридимерном интерфейсе выявляет неактивируемую петлю T7 в AtubA/β-тубулине. Ключевой остаток петли Т7 в AtubA, β-тубулине и BtubA выделен жирным шрифтом. Положение нуклеотида выделено серым цветом. (D) Крио-ЭМ анализ гетеродимера AtubA/B в присутствии GTP; обратите внимание, что на внутридимерном интерфейсе нуклеотид не обнаружен. Карты плотности представлены с точностью +-3,4 σ. (E) Вестерн-блоты эксперимента по совместной экспрессии и вытягиванию AtubA/B/B2 в клетках насекомых. После совместной экспрессии всех трех тубулинов AtubAHis6 был повторно выделен путем аффинной очистки, показавшей, что AtubA преимущественно связывается с AtubB2 в присутствии AtubB (последняя полоса). Приведенные результаты являются репрезентативными для двух независимых экспериментов. (F) Схема, показывающая, что свободный AtubB2 конкурентно связывается с предварительно сформированным димером AtubA/B, образуя гетеродимер AtubA/B2 путем высвобождения свободного AtubB. Учитывая, что AtubB2 не может связывать GTP и экспрессируется на более низком уровне, AtubB2 может модулировать сборку AtubA/B. Цитирование: Wollweber et al., Microtubules in Asgard archaea, Cell (2025), https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.02.027
Но это еще не все. В эукариотических клетках есть еще один важный элемент — микротрубочки, состоящие из белка тубулина. Они отвечают за транспорт веществ внутри клетки и за разделение хромосом при делении. Происхождение этих микротрубочек долго оставалось загадкой. И вот, в ходе новых исследований, ученые обнаружили подобные структуры и у Asgard! Тубулины Asgard образуют микротрубочки, хоть и меньшего размера, чем у эукариот.
Правда, такие тубулины встречаются далеко не у всех Asgard. И пока не ясно, какую именно функцию они выполняют. Возможно, они тоже участвуют в транспорте веществ, как и микротрубочки эукариот.
От простого к сложному: как Asgard могли дать начало новой жизни
Эти открытия заставляют задуматься: а не стали ли Asgard тем самым «толчком», который привел к появлению сложных клеток? Не исключено, что когда-то, в далеком прошлом, один из архей Asgard «захватил» бактерию своими выростами. Со временем эта бактерия превратилась в митохондрию — энергетическую станцию наших клеток. А потом появилось и ядро, и другие органеллы. Так, шаг за шагом, и возникла эукариотическая клетка.
Как считает профессор Пилхофер, цитоскелет Asgard мог сыграть ключевую роль в этом процессе. Именно он позволил этим археям формировать выросты, захватывать бактерии и давать начало новой, более сложной форме жизни.
AtubA/B быстро собираются in vitro и формируют редкие цитоскелетные структуры in vivo. (A) Интерференционная отражательная микроскопия (ИОМ) полимеризации AtubA/B в присутствии 1 мМ GpCpp, показывающая поле зрения ИОМ в 0 с (вверху) и 180 с (внизу). Масштабная линейка: 10 мкм. Наконечники стрелок указывают на растущий конец филамента. (B) Увеличение того же филамента, указанного в (A), показанного в разные моменты времени (масштабная линейка: 5 мкм) и в виде кимограммы ниже. Стрелки указывают на растущий конец филамента. (C) Временные изображения (масштабная линейка: 5 мкм) и соответствующая кимограмма филамента, растущего с обоих концов с разной скоростью. Стрелки указывают на концы филаментов на изображениях (синий: медленный конец; красный: быстрый конец); наклоны пунктирных линий на кимограмме соответствуют соответствующей скорости роста. (D) Наблюдаемые скорости роста (n = 62). Данные можно разделить на две группы (обозначены красным/синим цветом), напоминающие наблюдения в (C), со средними скоростями роста (+- SD) 1,6 +- 0,4 мкм/мин (n = 7) и 6,3 +- 1,3 мкм/мин (n = 55). (E) Временные изображения, показывающие случаи смятия и связывания филаментов (обозначены желтыми или белыми наконечниками стрел, соответственно). Масштабные линейки: 5 мкм. (F-H) Ультраструктурно-расширительная микроскопия (U-ExM) Ca. L. ossiferum (звездочками отмечены совместно культивируемые бактерии и археи) в сочетании с маркировкой объемного протеома NHS-эстером и окрашиванием иммунофлуоресценции после расширения с использованием антител к локиактину (F) или AtubA/B (G, контроль вторичных антител показан в H). Показаны проекции максимальной интенсивности. Филаментные структуры AtubA/B были обнаружены в подмножестве преимущественно вытянутых локиархейных клеточных тел (11/523 клеток в культурах из ранней логарифмической фазы роста). В отличие от этого, филаменты локиактина (F) были обнаружены во всех клетках и во всех локиархейных выступах. Масштабные линейки: 1 мкм (биологическая шкала). Цитирование: Wollweber et al., Microtubules in Asgard archaea, Cell (2025), https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.02.027
Сейчас ученые планируют детально изучить функции актиновых филаментов и тубулиновых микротрубочек у Asgard. Кроме того, они пытаются идентифицировать белки, находящиеся на поверхности этих микробов. Это позволит разработать антитела, с помощью которых можно будет «вылавливать» Asgard из смешанных культур микроорганизмов.
Как говорит профессор Пилхофер, «у нас еще много вопросов без ответа об археях Asgard, особенно в отношении их связи с эукариотами и их необычной клеточной биологии». Но одно можно сказать наверняка: изучение этих древних микробов — это увлекательное путешествие вглубь истории жизни на Земле, которое может изменить наше представление о самих себе. Ведь, возможно, в наших клетках до сих пор живут отголоски тех самых Asgard, которые заложили фундамент для всей сложной жизни, существующей на нашей планете.
Этот веб-сайт использует файлы cookie или аналогичные технологии для улучшения вашего просмотра и предоставления персонализированных рекомендаций. Продолжая использовать наш веб-сайт, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности
Версия PHP на сервере не соответствует минимально необходимой. Datalife Engine не сможет корректно работать на данной версии PHP. Версия PHP должна быть не ниже 8.0.0. Ваша установленная версия 7.4.3